Alternatif Poliadenilasyonun Triple Negatif Meme Kanserleri Açısından İncelenmesi

Date

2015-1-01

Author

Erson Bensan, Ayşe Elif
Can, Tolga

Metadata

Show full item record

This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Item Usage Stats

84
views

39
downloads

Cite This

Gen anlatım çalışmaları meme kanserinin tek bir hastalık olmadığını, alt tiplerinin olduğunu ortaya koymuştur. Meme tümörünün özelliklerinin bilinmesi etkili ve hedefli teşhis ve tedaviyi mümkün kılmaktadır. Meme kanserleri içerisinde triple negatif (TN) olarak geçen grup, hastaların %15-20’sinde ve genellikle genç kadınlarda ortaya çıkar, agresiftir, hızlı büyür ve prognozu kötüdür. Bu yüzden TN tümörlerin etiyolojisini anlamaya yönelik çalışmalara ihtiyaç vardır. Son yıllardaki bilimsel gelişmeler, transkripsiyon sonrası gen anlatım kontrolünün önemine ve kanser hücrelerinde bu mekanizmaların bozulmasının hücre transformasyonuna etkilerini ortaya koymuştur. Kanser hücrelerinde artan veya azalan mikroRNA düzeylerinin yanı sıra, mRNA’ların alternatif poliadenilasyon (APA) yoluyla 3’ UTR (translasyon olmayan bölge) uzunluklarını kısaltarak da mikroRNA’ların negatif etkilerinden kaçtıkları görülmektedir. APA’nın hızlı büyüyen hücrelerde ve kanser hücrelerinde protein düzeylerinde artışa yola açabileceği yenilerde anlaşılmıştır. Projede geliştirilen meta-analiz aracı ile mevcut gen anlatım verileri kullanılarak, UTR uzunluk değişimine uğrayan genlerin tanımlanması hedeflenmiştir. Biyoinformatik yaklaşımla 500’den fazla TN hasta verisi kullanılarak UTR uzunluk değişimleri tespit edilmiş, hücre hatları ve hasta örneklerinde bu değişimler RACE ve gerçek zamanlı PZR, Western blotlama ile doğrulanmıştır. Projenin sonunda elde edilen veriler meme kanserlerinde APA’ya bağlı UTR uzunluk değişimleri olduğunu ortaya koymuştur. Geleneksel gen anlatım deneylerinde UTR uzunluk değişimleri gözardı edilebilmekte olduğundan, bulgularımız onkogen aktivasyonu ve prognostik özelliklerle ilişkili olabilecek UTR kısalmasına uğrayan genlerin ortaya konması açısından önemlidir. Bu da TN meme kanserlerinin daha iyi anlaşılmasına katkı sağlayacaktır.

Subject Keywords

Onkoloji, Hücre biyolojisi

URI

https://search.trdizin.gov.tr/tr/yayin/detay/616064/alternatif-poliadenilasyonun-triple-negatif-meme-kanserleri-acisindan-incelenmesi
https://hdl.handle.net/11511/114003

Collections

Department of Biology, Project and Design