Model bir G-Proteine Kenetli Reseptör olan Maya Ste2p Feromon Reseptörünün Üçlü ve Dörtlü Etkileşimlerinin Çift Moleküllü Floresan Birleşme (BiFC) ve Förster Rezonans Enerji Transferi (FRET) Metotları ile Gösterilmesi

Download
2017
Cevheroğlu, Orkun
Son, D. Çağdaş
Bu projenin amacı, model bir G-proteine kenetli reseptör olan maya feromon reseptörü Ste2p’nin, üçlü ve dörtlü eşlemesinin çift moleküllü floresan eşleşme (BiFC) ve Förster rezonans enerji transferi kullanılarak gösterilmesi, reseptör agonisti olan maya α-faktör feromonunun, Ste2p oligomerleşmesi üzerindeki olası etkilerinin araştırılmasıdır. GPKRler, ökaryotlardaki en geniş hücre zarı reseptör ailesini oluşturmaktadırlar. Hücre dışı kimyasal (hormonlar, nörotransmiterler, kalsiyum iyonları v.b.) ve duyusal (ışık, koku ve tat molekülleri) gibi çok çeşitli uyaranın algılanmasındaki rolleri göz önünde bulundurulduğunda, GPKR ailesi en önemli duyu sistemlerinden biridir 1 . Konunun seçilmesindeki nedenler üç başlık altında özetlenebilir. İlk olarak, birçok hücre dışı uyaran, hücrenin içine bu reseptörlerle iletilmektedir 2 . İkinci neden, bu reseptörlerdeki mutasyonlar ve fonksiyonel problemler diyabet, hiperkalsemi, hipertansiyon, hipotiroid, retinitis pigmentosa, obezite, kanser ve birçok psikolojik hastalıklara neden olmaktadır 3 . Üçüncü olarak, reçeteli ilaçların yaklaşık %50’si bu reseptörleri hedeflemektedir, dolayısıyla GPKRler moleküler farmakoloji araştırmalarının odak noktasında yer almaktadırlar 4 . GPKR eşleşmesi kabul görmüş bir olgudur, ancak GPKRlerin ne amaçla eşleştikleri henüz bilinmemekle birlikte; bu eşleşmenin reseptör intörnalizasyonu, olgunlaşması, işlev ve farmakolojisi üzerinde önemli rolleri olduğu düşünülmektedir. Daha önceki araştırmalarımızda yeşil protein (EGFP) ve BiFC tekniğini kullanarak Ste2p proteinin kendisi ile etkileşimini tayin edilmiştir. Bölünmüş EGFP parçaları, N-EGFP ve CEGFP ile yedinci transmembran bölgeden hemen sonra işaretlenen Ste2p reseptörleri maya hücrelerinde aynı anda üretildikten edildikten sonra, ikili reseptör eşleşmesi BiFC metodu ile gösterilmiştir. Bu projede ise Ste2p reseptörünün üçlü ve dörtlü etkileşimleri incelenmiştir. Bu amaç doğrultusunda reseptör yedinci transmembranı takip eden bölgeden hem tam uzunluktaki mCherry floresan proteini hem de biri N-mCherry diğeri C-mCherry protein parçaları ile işaretlenmiştir. Proje kapsamında, EGFP ve mCherry floresan proteinleriyle ve bu proteinlerin parçalarıyla işaretlenmiş Ste2p reseptörlerinin, konfokal mikroskop, BiFC ve FRET yöntemleri kullanılarak çoklu etkileşimleri incelenmiştir. Bu proje neticesinde model GPKR olan Ste2p maya feromon reseptör eşleşmesinin yalnızca ikili bir etkileşimden ibaret olmadığı, üçlü ve dörtlü bir etkileşimin varlığı gösterilmiştir. Ste2p ikili etkileşimi ile ilgili yapılmış araştırmalar bu model GPKR’nin agonistinin, eşleşmeye herhangi bir etkisinin olmadığını göstermiş; ancak α-faktörün çoklu reseptör etkileşimini etkileyebileceği yönünde bir hipotez sunmuştur. Bu projede ligandın çoklu reseptör 6 etkileşimine etkileri de araştırılmıştır. Proje sonucunda elde edilen bulgular, GPKR tetramer etkileşmesinin mevcut literatüre önemli katkılarda bulunacağı öngörüsündeyiz.

Suggestions

A sequential classification algorithm for autoregressive processes
Otlu, Güneş; Candan, Çağatay; Çiloğlu, Tolga; Department of Electrical and Electronics Engineering (2011)
This study aims to present a sequential method for the classification of the autoregressive processes. Different from the conventional detectors having fixed sample size, the method uses Wald’s sequential probability ratio test and has a variable sample size. It is shown that the suggested method produces the classification decisions much earlier than fixed sample size alternative on the average. The proposed method is extended to the case when processes have unknown variance. The effects of the unknown pro...
Implementation and comparison of different constitutive models in deep drawing process
Çoğun, Ferah; Darendeliler, Haluk; Department of Mechanical Engineering (2013)
The aim of the study is to find out the effects of different models namely; BBC2008-8p, Yld2003-8p, Hu2003, isotropic hardening, kinematic hardening, combined hardening and Hill’48 on simulation of cylindrical, square and round bottom cup drawing processes. For this purpose two different sheet materials, SS304 stainless steel and DKP6112 steel with 1 mm thickness and three different punch travels were used in both computer simulation and experimental phase of this study. BBC2008-8p, Yld2003-8p and Hu2003 mo...
A Critical and methodological assessment of Zafer Toprak’s historical studies
Yılmaz, Tülay; Ergut, Ferdan; Department of History (2017)
The main goal of this study is to examine Zafer Toprak’s methodological approach to historical studies. Toprak’s work has influenced many areas of academic disciplines such as economic and social history writing. His studies focused especially on the modernization era and the Republican period of Turkey. He stands apart from historians who came before him in respect to his approach toward social and economic life of the late Ottoman era and the early Republican period. His studies on the period of CUP (Comm...
The metaphorical (re)construction of Turkey in political discourse: a corpus-driven critical metaphor analysis
Efeoğlu, Esranur; Işık Güler, Hale; Department of English Language Teaching (2015)
This study investigates and describes the conceptual (re)construction of Turkey as a sociopolitical structure in domestic and international political discourse. The study identifies the source domains and concepts mapping into the target domain of Turkey, as well as the manifestations of related conceptual metaphors. A corpus-driven Critical Metaphor Analysis is carried out on the corpus of Political Discourse (POLDIS) which consists of articles from Turkish, British and American newspapers in a designated ...
A new route to synthesis of nanocomosites by using an unsaturated polyester matrix
Toprak, Pelin; Yılmazer, Ülkü; Department of Chemical Engineering (2004)
This study was conducted to investigate the effects of organoclay type and concentration on the nanocomposites synthesized by أIn-Situ Polymerizationؤ and أPrepolymerizationؤ methods. In-Situ Polymerization Method was in fact a new route which consisted of dispersing the monomers; propylene glycol, maleic anhydride and o-phthalic anhydride into the galleries of montmorillonite followed by subsequent polymerization. The Prepolymerization Method involved the addition of montmorillonite to the previously synth...
Citation Formats
O. Cevheroğlu and D. Ç. Son, “Model bir G-Proteine Kenetli Reseptör olan Maya Ste2p Feromon Reseptörünün Üçlü ve Dörtlü Etkileşimlerinin Çift Moleküllü Floresan Birleşme (BiFC) ve Förster Rezonans Enerji Transferi (FRET) Metotları ile Gösterilmesi,” 2017. Accessed: 00, 2020. [Online]. Available: https://app.trdizin.gov.tr/publication/project/detail/TVRZeU5EYzM.