Kefirden İzole Edilen Probiyotik Lactobacillus Acidophilus Suşlarının Rapd-Pcr İlealttiplemesi

2011-12-31
Kapsam: Bu çalışmada genotipik farklılığı ortaya koyan RAPD-PCR (randomly amplified polymorphic DNA - Polimeraz Zincir Reaksiyonu) ile L. acidophilus suşlarının alttiplemesi planlanmaktadır. Yöntem: RAPD yönteminde gelişigüzel biçimde sentezlenmiş primerler yardımı ile çoğaltılan DNA bölgeleri suş bazında değişiklik göstermektedir. Bu da farklı suşların tanısını kolaylaştırmak da birbirine daha yakın olan suşların ise benzerliklerini göstermeketedir. Bu benzerlikler ve farklılıklar RAPD deneylerinin sonucunda dendogram kullanılarak gösterilir. Planlanan çalışmamızda Kefir tanelerinden izole edilmiş olan L.acidophilus suşları ve ticari olarak kullanılmakta olan L. acidophilus suşları RAPD (randomly amplified polymorphic DNA) sistemi içinde ayrıştırılacaktır. Gerekçe: Bu çalışmada genotipik farklılığı ortaya koyan RAPD-PCR (randomly amplified polymorphic DNA - Polimeraz Zincir Reaksiyonu) ile L. acidophilus suşlarının alttiplemesi projenin ana amacıdır. Beklenen bulgu/sonuç: Bu yöntem ile suşların genetik farklılıkları (strain diversity) tanımlanabilecek, diğer ticari kültürlerden genotipik farklılıkları gözlemlenebilecektir. Bu sayede ticari olarak kullanılmakta olan ve yurtdışından gelen probiyotik organizmalar yerine Türkiye orijinli kefir izolatı olan kültürler probiyotik yoğutlara eklenebilecek, Türkiye izolatlarının moleküler bazda farklılaştırılması sağlanmış olacak ve önemli suşlar için patent uygulamaları için bir bilgi birikimi oluşturulabilecektir.

Suggestions

Tatlı Su Balıklarının Yüzey Mukusunda Yaşayan Bakterilerin Çoklu Antibiyotik Dirençlerinin Genetik Analizi
Gözen, Ayşe Gül(2012-12-31)
Bu projenin amacı yüksek seviyede çoklu antibiyotik direnci gösteren bakteri izolatlarında integron bazlı antibiyotik direnç gen kasetlerinin varlığını araştırmaktır. Daha önce yaptığımız çalışmalarda Mogan Gölü’nden yakalanan tatlı su balıklarının yüzey mukusundan izole edilen bakterilerin yüksek seviyede çoklu antibiyotik direnci gösterdiğini bulmuştuk. Fakat bu çoklu direncin genetik temeli henüz tespit edilmemiştir. Proje kapsamında araştırmanın amacına yönelik olarak önceki çalışmalarımızda test ettiği...
Laktik starter suşlarında ribotipleme (Ribotyping) ve veri tabanı oluşturulması
Başağa, Hüveyda; Öğel, Zümrüt; Gürakan, Candan; Dede, Filiz(2002)
Bu çalışmanın amacı Lactobacillus plantarum suşlarının tanımlanmasında PCR ribotipleme yönteminin uygulanabilirliğini araştırmaktır. Alternatif bir yöntem olarak RAPD de kullanılmıştır. PCR ribotipleme 16S-23S rRNA genleri arasındaki bölgede bulunan farklılıkları esas alan bir moleküler tanımlama yöntemidir ve primer çifti bu korunmuş bölgeler kullanılarak tasarlanır. Buna karşın RAPD'de dizilimi rastgele seçilmiş kısa oligonükleotitler kullanılır. Sonuç olarak, RAPD'nin Lactobacillus'ları suş seviyesinde a...
Protein kafeslerine hapsedilmiş paramanyetik ultra küçük gadolinyum oksit nanoparçacıklarının sitotoksisitesi
Eke, Binay; Volkan, Mürvet; Güray, Nülüfer Tülün(2017)
Bu projenin amacı tedavi edici ve görüntülemeye uygun kimyasalların tek bir nanoparçacıkta birleştirilmesi ile kanser tedavisini eş zamanlı takip etmeye uygun bir platform hazırlamak ve hazırlanan bu nanoparçacığın in vivo kullanımı nedeniyle hücre içindeki toksikolojik karakterizasyonunu gerçekleştirmektir. Bu amaca yönelik olarak MRI, nükleer (SPECT) ve CT yöntemlerine uygun, biyouyumlu, ferritin kafes içine yerleştirilmiş gadolinyum oksit nanoparçacıkları hazırlanmıştır. Daha sonra parçacıkların yüzeyi ...
Bacillus subtilis dipeptid sentataz geninin klonlanması ve ifade edilmesi
Karataş, Ayten Yazgan; Özcengiz, Gülay; Alaeddinoğlu, Gürdal N.(1999)
Bu çalışmada, Bacillus subtilis 168 (PY79) tarafından nonribosomal olarak sentezlenen, L-alanin ve L-anticapsin'den oluşan dipeptid bir antibiyotik olan bacilysinin biyosentezinden sorumlu gen ve gen kümelerini belirlemek ve karakterize edebilmek için klonlama çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Mini-Tn10 taşıyan pIC333 vektörü ile "Tn10 insertion mutation" metodu uygulanmış ve gayet başardı sonuçlar elde edilmiştir. Bu metod sonucunda bacilycin üretemeyen ve $KA_1, KA_2, KA_3 ve KA_4$ olarak isimlendirilen d...
Effects of attachment styles on prefrontal cortex during naturalistic social interaction: An fNIRS based hyperscanning study
Yargıçoğlu, Burcu; Çakır, Murat Perit; Department of Cognitive Sciences (2022-1)
This study investigates possible differences of prefrontal cortex (PFC) activity as well as brain-to-brain coordination across PFCs of dyads during naturalistic social interaction from an attachment theory perspective by employing functional near-infrared spectroscopy (fNIRS) hyperscanning. Male participants with right-hand dominance (N=48) were administered Turkish Experiences in Close Relationship Scale (Sumer, 2006) for assessment of predominant adult attachment styles (Secure:27, Insecure: 21) and playe...
Citation Formats
G. C. Gültekin, “Kefirden İzole Edilen Probiyotik Lactobacillus Acidophilus Suşlarının Rapd-Pcr İlealttiplemesi,” 2011. Accessed: 00, 2020. [Online]. Available: https://hdl.handle.net/11511/59419.