Streptomyces clavuligerus NRRL3585 ve S. clavuligerus Antibiyotik Aşırı Üretici Mutantlarında Sekonder Metabolit Üretimini Etkileyen Genlerin RNA Seviyesinde Araştırılması

Date

2017-12-31

Author

Özcengiz, Gülay

Metadata

Show full item record

This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Item Usage Stats

102
views

0
downloads

Streptomyces cinsi klinik alanda kullanılan antibiyotiklerin büyük bir çoğunluğunu üretmesiyle tanınmaktadır. Bu antibiyotikler, organizma tarafından ikincil metabolizma sırasında üretilmekte ve genel ismiyle ikincil metabolitler olarak ifade edilmektedir. İkincil metabolitlerin bir kısmı farmakolojik özelliklere sahip olup, antibiyotik, antitumorigenik, antifungal özellikler gösterebilmektedir. Streptomyces clavuligerus türünün ürettiği çeşitli sekonder metabolitler arasında sefamisin C, klavulanik asit, klavam-2-carboksilat, 2-formiloksimetilklavam ile çeşitli poliketid antibiyotikleri yer almaktadır. Yapılan draft genome sekanslamasında S. clavuligerus’un kromozomunda 23 olası sekonder metabolit gen kümesi, plasmidinde (pSCL4) ise 25 olası sekonder metabolit gen kümesi bulunmuştur. Laboratuvarımızda, S. clavuligerus ve çeşitli antibiyotik aşırı üretici mutantları üzerine yapmış olduğumuz proteom çalışmaları, bu bulguları destekler nitelikte olmakla birlikte, sekonder metabolizmada aktif rol oynayan çeşitli poliketid sentaz ve NRPS ile hybrid NRPS/PKS sistemlerinin varlığını ortaya çıkarmış, daha birçok hipotetik ve bilinmeyen proteinlerin ifadelerini belirleyerek S. clavuligerus fizyolojisi hakkında önemli bulgular ortaya koymuştur. Bu proje ile amacımız, proteom düzeyinde belirlenen bulguların RNA düzeyinde meydana gelen ve protein ifadelerini etkileyen olası regülasyon pattern’larının ortaya çıkarılabilmesidir.

Subject Keywords

Mikrobiyoloji

URI

https://hdl.handle.net/11511/58871

Collections

Department of Biology, Project and Design

Suggestions

OpenMETU
Core

Bacillus subtilis Standart Suş (PY79) ile Basilisinin Bloke Edildiği Suşun (OGU1) Karşılaştırmalı Dinamik Sekretom Analizi İşlerel, Tekin Elif; Özcengiz, Gülay(2018) Bacillus türleri, antimetabolik ve farmakolojik aktiviteye sahip çok çeşitli ikincil metabolitlerüretmektedir. B. subtilis?e ait biyoaktif peptidlerin etkilerinin sadece antimikrobiyal aktivite ilesınırlı olmadığı bilinmektedir. B. subtilis tarafından üretilen basilisin, N-terminalinde L-alanineand C-terminalinde non-proteinojenik bir amino asit olan L-anticapsin?den oluşan dipeptidyapısı ile bilinen en küçük antibiyotiktir. Basilisin biyosentezinin dinamikleri ve molekülerregülasyonu ile ilgili literatür b...
An exploratory study on features of intelligent office buildings and development of an assessment tool Gündoğan, Handan; Dikmen Toker, İrem; Atasoy Özcan, Güzide; Department of Civil Engineering (2021-12) Intelligent office buildings have a high-tech image that embraces advanced technologies to enhance the quality of life for building occupants and energy efficiency. The literature's exploration of the Intelligent Building (IB) concept indicated that the concept has broad aspects, which resulted in losing its focus. In this regard, this thesis aims to address two central questions of how the IB concept is currently interpreted by the building sector representatives and what are the intelligent features of an...
The Use of Incentives in Fostering Green Buildings Gündeş, Selin ; Yıldırım, Şiar Umut (Middle East Technical University, Faculty of Architecture, 2015-12-15) Çalışmada dünyada yaygın olarak kullanılan yeşil bina teşvik sistemlerinin uygulanabilirliği, Türkiye örneği üzerinde değerlendirilmiştir. Yerel yönetimlerle yapılan görüşmeler sonucunda teşvik sistemlerinin etkin bir şekilde uygulanabilmesi için gerekli olan şartlar, karşılaşılabilecek zorluklar ve fırsatlar belirlenmiş ve değerlendirilmiştir. Sonuçlar, Türkiye örneğinde düşük maliyetli veya maliyete gereksinim duyulmayan grupta en elverişli teşviklerin pazarlama yardımı ve hızlandırılmış inceleme/izin old...
Energy performance of duble-skin fa̧acades in intelligent office buildings : a case study in Germany Bayram, Ayça; Elias Özkan, Soofia Tahira; Department of Architecture (2003) The building industry makes up a considerable fraction of world̕s energy consumption. The adverse effects of a growing energy demand such as depletion in fossil fuel reserves and natural resources hassled the building industry to a search for new technologies that result in less energy consumption together with the maximum utilization of natural resources. Energy- and ecology-conscious European countries incorporated the well-being of occupants while conducting research on innovative technologies. In view o...
Multispectral multi-temporal crop cover classification over Türkiye using random forest algorithm Dönmez Altındal, Elif; Yılmaz, Mustafa Tuğrul; Department of Civil Engineering (2022-7-28) Accurate crop cover maps are beneficial for various aspects like water resources management, crop yield prediction, regulation insurance policies, and investigation of the effects of climate change. In this thesis, agricultural crop mapping is performed over Türkiye. Sentinel-2 Level-2A images with 10-meter spatial resolution acquired between March 15, 2019, and October 15, 2019, are reduced to 15-day median images. In addition to spectral bands, Normalized Difference Vegetation Index (NDVI) and Normalized ...

Citation Formats

G. Özcengiz, “Streptomyces clavuligerus NRRL3585 ve S. clavuligerus Antibiyotik Aşırı Üretici Mutantlarında Sekonder Metabolit Üretimini Etkileyen Genlerin RNA Seviyesinde Araştırılması,” 2017. Accessed: 00, 2020. [Online]. Available: https://hdl.handle.net/11511/58871.