Date

2019-08-15

Author

Persil Çetinkol, Özgül

Metadata

Show full item record

This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Item Usage Stats

168
views

0
downloads

Cite This

Üçlü DNA sarmal yapıları anti-gen ve anti-sense stratejilerinin ortaya çıkması ile önem kazanmıştır. Fakat, anti-gen stratejilerindeki en temel sorun, oluşturulan üçlü sarmal yapıların yeterince sağlam olmaması ve üçüncü dizinin kolaylıkla ikili sarmaldan ayrılmasıdır. Bu sorunun bir çözümü üçlü sarmal yapıların karalılığını bu yapılara bağlanan küçük molekülleri kullanarak arttırmaktır. Bu projenin de en temel amacı üçlü sarmal DNA yapılarına kuvvetli bir şekilde bağlanan ve bu yapıları sağlamlaştıran ilaç adayı yeni molekülleri ortaya çıkartmaktır. Proje kapsamındaki amaçlarımızdan ilki azasiyanin 3 (aza3-Azametil) bileşiğinin üçlü sarmal yapıya sahip nükleik asitler ile olan etkileşimlerini in-vitro çalışmaları ile incelemek, karakterize etmek ve azasiyanin moleküllerinin in-vivo çalışmalarda üçlü sarmal oluşturan GAA·TTC tekrar dizinini içeren maya hücrelerinde göstermiş olduğu etkiye dayanak sağlamak ve açıklık getirmektir. Bir diğer temel hedefimiz ise Azametil türevleri olan Azaetil, Azapropil ve Azaizopropil moleküllerini sentezleyerek, bu moleküllerin üçlü sarmal yapılar ile etkileşimlerini incelemek ve molekül yapısının bağlanma üzerindeki etkisini açığa çıkartmaktır. Sonuç olarak, rekabetçi diyaliz yöntemi kullanılarak azasiyaninlerin farklı nükleik asit dizinleri ve yapılarına (tekli sarmal, ikili sarmal, üçlü sarmal vb.) karşı seçicicilikleri incelenerek, bu moleküllerin üçlü sarmal yapılara karşı seçici oldukları belirlenmiştir. Yürütülen spektroskopi (UV-Vis, CD, Floresans) çalışmaları ile bu moleküllerin özellikle de benzimidazoller içerisinde Azametilin üçlü sarmal yapılara kuvvetli bir şekilde bağlandığı ve bu yapıların kararlılığını arttırdığı ortaya çıkartılmıştır. Bağlanma kuvvetinin benzimidazol halka yapısında yer alan artan zincir uzunluğu ve dallanmadan negatif etkilendiği gözlemlenmiştir. Üçlü sarmal yapı olarak belirlenen polyd(A)·polyd(T)·polyd(T)ye kuvvetli olarak bağlandığı belirlenen Azametilin hangi koşullar altında (pH, tuz, vb.) bağlandığı, bağlanma modu ve bağlanma oranı belirlenmiştir. Son olarak, termal denatürasyon deneyleri ile ayrıca Azametilin daha önceki çalışmalar sonucunda ortaya çıkarılan coralyne gibi polyd(A)·polyd(T) ikili sarmal yapısını bozarak, üçlü sarmal yapının oluşmasını sağladığı belirlenmiştir. Sonuç olarak, bu proje ile azasiyaninlerin, özellikle de Aza5 ve Azametilin anti-gen tedavilerinde veya in-vivoda üçlü sarmal yapıları belirlemede kullanılabilecek aday moleküller oldukları ortaya çıkartılmıştır.

Subject Keywords

azasiyanin, dna, üçlü sarmal, anti-gen tedavisi, i̇nterkalasyon.

URI

https://hdl.handle.net/11511/95891

Collections

Department of Chemistry, Project and Design