CXXC5 Proteinin İşlevsel Özelliklerinin Tanımlanmasında Protein Partnerleri

Date

2016-12-31

Author

Muyan, Mesut
Erson Bensan, Ayşe Elif
Banerjee, Sreeparna

Metadata

Show full item record

This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Item Usage Stats

300
views

0
downloads

Östrojenler (E2) hücre büyümesinden ölümüne kadar bir çok süreçte önemli rol oynarlar. E2 etkisi transkripsiyon faktörleri olan östrojen reseptörleri (ER) tarafından düzenlenir. CXXC5 E2 sinyal yolağı yanıt genidir. CXXC5, içerdiği çinko parmak-CXXC (ZF-CXXC) ünitesi nedeniyle metile olmamış CpG dinükleotidleri içeren ve transkripsiyonel olarak aktif DNA bölgeleri CpG adalarına bağlanan ZF-CXXC protein grubunun üyesi olduğu düşünülmektedir. ZF-CXXC proteinlerinin CpG dinükleotidlerine bağlanması sitosin metilasyonlarını engelleyerek gen transkripsiyonlarının düzenlenmesini sağlar. CXXC5’in yapısı bilinmemektedir ve işlevlerine yönelik çalışmalar sınırlıdır. yönelik çalışmalar da sınırlı olmasına rağmen, CXXC5’in birçok farklı sinyal yolağına yanıtta bir epigenetik faktör ve/veya koregülatör olarak hücre metabolizmasının, çoğalmasının, farklılaşmasının ve ölümünün transkripsiyonel olarak düzenlenmesinde rol oynadığı öne sürülmüştür. Bu nedenlerle, CXXC5’in E2 yanıtlı gen ifadelerinin düzenlenmesine katılarak E2’nin regüle ettiği hücre çoğalması ve ölümü olaylarında temel bir rol oynayacağını öngörüyoruz. Bu doğrultuda başvurumuzun amacı, CXXC5’in proteinin partnerlerinin belirlenmesi ve böylece bu proteinin moleküler mekanizmasını açıklayan bir modelinin geliştirilmesine ve böylece işlevlerinin tanımlanmasına öncülük edecektir.Elde edeceğimiz bulguların, meme dokusu gibi östrojen hedef dokusu hastalıklarına karşı yeni tanı ve tedavi yöntemlerinin geliştirilmesine katkıda bulunacağını düşünmekteyiz.

Subject Keywords

Yaşam Bilimleri, Protein Yapısı, İşlevi ve Kararlılığı, Kanser Moleküler Biyolojisi, Moleküler Biyoloji ve Genetik, Hücre Genetiği

URI

https://hdl.handle.net/11511/58862

Collections

Department of Biology, Project and Design

Suggestions

OpenMETU
Core

Hücre içi VEGF trafiğinin kanser gelişimi ve anjiyogenezine etkisinin incelenmesi. Banerjee, Sreeparna; Tunçer, Sinem(2016-12-31) Anjiyogenez, var olan damarlardan yeni kan damarı oluşumu süreci olup, kanser büyümesi ve yayılımı için gerekli bir basamaktır. Anjiyogenik faktörler içinde VEGF (Vasküler Endotel Büyüme Faktörü), tümör anjiyogenezinin en önemli aktivatörüdür. Anjiyogenezin inhibe edilmesi, hem tumor büyümesini hem de metastazını engelleyeceğinden, kanser tedavisi için son derece önemlidir.Bu projede, hücre sitoplazması ve çekirdeği arasındaki VEGF traifiği incelenecek, VEGF’in hücre içi hareketinin anjiyogeneze etkileri ay...
NEK6’nın Apoptoz, Hücre Döngüsü ve İnvasyon Üzerindeki Etkisinin Prednizon Dirençli Multipl Miyelom Hücre Hattında İncelenmesi Gündüz, Ufuk; Mutlu, Pelin; Keskin, Dilek(2015-12-31) Mitotik hücre döngüsünün hatasız bir şekilde başlaması ve devam etmesinde önemli role sahip olan NEK6, NIMA-ilişkili (Nek) serin-treonin kinazlardan birisidir. Son zamandaki çalışmalar, NEK6 gen mutasyonlarının; iğ ipliklerinde bozukluklara, anormal kromozom ayrılmasına, mitozun durdurulmasında ve apoptozda sorunlara neden olduğu göstermektedir.Bu çalışmada ilaç dirençli RPMI-8226 miyelom hücre hattında NEK6 gen ifadesi, siRNA ile susturularak, hücre döngüsü, DNA hasar yanıtı ve apoptozda rol aldığı bilinen...
MikroRNA miR-106b nin ifadesinin artmasının meme kanseri üzerine olan etkisi Banerjee, Sreeparna; Erson Bensan, Ayşe Elif; Muyan, Mesut(2013-12-31) Laboratuvarımızdaki çalışmalar, meme kanserine yol açan muhtemel moleküler mekanizmaları çözümlemek üzerine temellendirilmiştir. Bu bağlamda, mikroRNA regülasyon mekanizmaları önemli rol oynamaktadır. Laboratuvarımızda daha önce yapılan çalışmalarda bazı mikroRNA ların (örneğin miR-125b) meme kanseri oluşumu üzerine etkileri incelenmiştir. Belirli mikroRNA ların ifadesindeki azalma ya da artmanın kanser oluşumuna nasıl etki ettiği çalışılmıştır. Bu proje kapsamında ise pek çok kanser türünde artışı gösteril...
C/EBPβ’nın Caco-2 Hücre Farklılaşması Sürecinde İndüklenen Otofajideki Rolünün Anlaşılması Banerjee, Sreeparna(2015) Bağırsak epitel hücrelerinin dengeli ve sürekli üretimi ile ilgili moleküler mekanizmalar tamolarak aydınlatılmış değildir. Karmaşık bir süreç olan farklılaşma, çeşitli hücre dışı ve içisinyaller, sinyal yolakları ve bu sinyal-sinyal yolakları tarafından aktive veya inhibe edilentranskripsiyon faktörleri tarafından düzenlenmektedir. Hücre içi Ca2+ seviyesindeki değişim,glikoz veya amino asit yoksunluğu gibi düzensizlikler, endoplazmik retikulum (ER) stresyanıtına yol açar. Bilinmektedir ki, ER stresi ve oto...
Meme dokusunun gelişim aşamalarının APA açısından analizi Erson Bensan, Ayşe Elif; Kiriş, Erkan; Muyan, Mesut; Gürsel, Mayda; Banerjee, Sreeparna; Terzi Çizmecioğlu, Nihal(2018-12-31) Farklı kanserlerin altında yatan mekanizmaların anlaşılmasında gen anlatım çalışmaları çok önemli olmuştur. Bu çalışmalar sayesinde anlatım düzeyleri bozulan pek çok mRNA bulunmuştur. Ancak, geleneksel gen anlatım çalışmaları, mRNA izoformlarının tespitinde ve miktarlarının ölçülmesinde yetersiz kalmaktadır. Bu projenin amacı, geliştirmiş olduğumuz özel bir yazılımla meme dokusunun gelişim aşamalarındaki değişimleri incelemektir.

Citation Formats

M. Muyan, A. E. Erson Bensan, and S. Banerjee, “CXXC5 Proteinin İşlevsel Özelliklerinin Tanımlanmasında Protein Partnerleri,” 2016. Accessed: 00, 2020. [Online]. Available: https://hdl.handle.net/11511/58862.