Moleküler Alt Tipleme Kapasitesi Kurulması

2012-12-31
Günümüzde gıda kaynaklı salgınların tespitinde geleneksel belirleme yöntemlerinin yanı sıra genetik tipleme teknikleri de kullanılmaktadır. Önceleri serotipleme teknikleri ile yetersiz tiplendirme yapılabilirken günümüzde bakteri farklılıklarının tespitinde fenotipik ve genotipik yöntemler kullanılmaktadır. Gıda kaynaklı patojenlerinin olarak tiplenmesinde en çok kullanılanlar serotipleme ve faj tiplemedir. Fenotiplemenin yetersiz olduğu durumlarda daha hızlı, daha doğru sonuçlar veren genotipleme yöntemleri kullanılmaktadır. Bunlar içinde tüm genomun restriksiyon enzimleri ile parçalanması esasına dayanan vuruşlu alan jel elektroforezi (PFGE) altin stadart olarak kullanilmaktadir.. Alt tiplerin birbiri ile aynı veya benzer şekilde gruplaşıp gruplaşamadığı incelenmekte, gruplaşma gösteren izolatların ortak kaynaktan alınıp alınmadığına dair epidemiyolojik çalışmalar yapılmaktadır. Epidemiyolojik çalışmalar sonunda muhtemel bulaşma kaynağı olan gıda tespit edilir ve öngörülen kaynakta yapılan analizler sonucunda gözlenen gruplaşmaların salgın olup olmadığı belirlenir. Ülkemizde bu eksikliğin giderilmesi için yapılan çalışmalar çogunlukla insan klinik örneklerinin alttiplenmesi üzerinedir. Bu çalışmaların çiftlikten/tarladan çatala kadar uzanan zincirin tüm halkalarına yayılması gerelidir. Vuruşlu alan jel elektroforezi (PFGE) ile tiplendirme: Vuruşlu alan jel elektroforezi CDC PulseNet protokolüne göre yapılacaktır. Turkiye’de izole edilen gida kaynakli izolatların PFGE patternlarindan olusturluacak dendogramlari dünyada yaygın bulunan PFGE izleri ile karsilastirilacaktir. Buna ilaveten Türkiye’ye özgü PFGE izlerinin olup olmadığı incelenecektir. Izolat ile bilgiler Pathogen Tracker adlı internet ağına yüklenecektir.

Suggestions

Moleküler Yapısal Değişikliklerin Kuvvet Kipli Raman Spektroskopisi ile Tespiti
Bek, Alpan; Demirtaş, Özge(2016-12-31)
Bu projede amaç Raman spektroskopisi yöntemi ile nano ve mikro elektromekanik sistemlerin (NEMS/MEMS) birleştirilmesiyle çalışan bir “dış kuvvet altında moleküllerin geçirdiği yapısal değişiklikleri kontrollü bir ortamda ölçmeye yarayan moleküler diagnostik” aygıtı (FORce ModulatEd Raman Spectroscopy - FORMERS) üretmek ve çalıştırmaktır. Bu aygıtın Raman spektroskopisine dayalı olarak tek bir molekülün üzerine uygulanan kuvvet altında geçirdiği yapısal değişikliklerin tespitine olanak sağlaması, yüzey artır...
Protein kafeslerine hapsedilmiş paramanyetik ultra küçük gadolinyum oksit nanoparçacıklarının sitotoksisitesi
Eke, Binay; Volkan, Mürvet; Güray, Nülüfer Tülün(2017)
Bu projenin amacı tedavi edici ve görüntülemeye uygun kimyasalların tek bir nanoparçacıkta birleştirilmesi ile kanser tedavisini eş zamanlı takip etmeye uygun bir platform hazırlamak ve hazırlanan bu nanoparçacığın in vivo kullanımı nedeniyle hücre içindeki toksikolojik karakterizasyonunu gerçekleştirmektir. Bu amaca yönelik olarak MRI, nükleer (SPECT) ve CT yöntemlerine uygun, biyouyumlu, ferritin kafes içine yerleştirilmiş gadolinyum oksit nanoparçacıkları hazırlanmıştır. Daha sonra parçacıkların yüzeyi ...
Yeşil Yapraklı Sebzelerde Pestisit Kalıntılarının Uzaklaştırılması için Yöntem Geliştirilmesi
Mert, Behiç; Söyler, Ulviye Betül(2015-12-31)
Bu projede hedeflenen mekanik uzaklaştırma yöntemlerinin denenerek yetişitirme esnasında bitkiye nüfuz eden çeşitli pestisit kalıntılarının hangi yüzdelerde uazklaştırılabildiğinin tespitidir. Sebze ve meyve üretiminde böcek istilasını önleyebilmek ve ürün verimini artırmak amacıyla kullanlan pestisitler aslında belirli düzeylerin üzerinde insan vücuduna alındığında toksik etki yapmaktadır. Kimi zaman bu etki uzun zamanda ortaya farklı hastalık türleri olarak çıksa da kimi zaman da bulunan kalıntı düzeyine ...
Biyoaktif yedili halka sistemlerinin fischer karben koplekslerinin 4-hidroksi-4-alken-2-siklobutenon türevleriyle olan reaksiyonlarıyla sentezlenmesi
Zora, Metin; Özarslan, Evren; Şahpaz, Filiz(1997-02-28)
Bu projede farklı iki yöntem kullanılarak yedili halka sistemlerinin sentezine çalışılmıştır. İlk yöntem, metal karben komplekslerinin (2) 4-hidroksi-4-alken-2-siklobutenon (1) türevleriyle olan tepkimesinden oluşmuştur. Bu yöntem beklenilenin aksine yedili halka sistemlerini değil hidrokinon türevlerini (13) üretmiştir. Çalışmalarımızdan siklobutenon l deki alken grubunun yeteri kadar reaktif olmadığı, bu nedenle metal karben kompleksi 2 ile koordinasyon yapmadığı ve tepkimeye girmediği anlaşılmıştır. Hidr...
Dil Fonksiyonlarının Elektrofizyolojik Ölçümü.
Cedden, Gülay(2010-12-31)
Bu projenin amacı elektrofizyolojik yöntem ile beynimizdeki dil fonksiyonlarını araştırmaktır. Olaya ilişkin beyin potansiyellerinin elektrofizyolojik ölçümleri, bilişsel süreçlerin anlaşılmasına ışık tutabilecek önemli bir yöntemdir. Elektrofizyolojik ölçüm yöntemini (EEG) kullanarak, tek dilli ve çok dilli insanlarda dilin oluşan kimi fonksiyonları saptamak ve böylece dil işlemlenmesinin ilgili yeni bulgulara varmak günümüzde artık mümkündür ve bu projede kapsamında bu tür bir çalışma Türkiye'de ilk def...
Citation Formats
Y. Soyer, “Moleküler Alt Tipleme Kapasitesi Kurulması,” 2012. Accessed: 00, 2020. [Online]. Available: https://hdl.handle.net/11511/59421.