İnsan Kolon Adenokarsinoma Hücrelerinde Sodyum Bütirat Konsantrasyonuna Bağlı Oluşan Yapısal ve İçeriksel Farklılaşmaların Raman, FTIR ve Terahertz Spektroskopisi YöntemleriyleAraştırılması

2015-12-31
Severcan, Feride
Severcan, Mete
Altan, Hakan
Esentürk, Okan
Gök, Seher
Şimşek Özek, Nihal
Özer, Zeynep
Kolon kanseri dünyada en çok görülen ikinci kanser tipidir. Hücredeki proliferasyon, farklılaşma ve apoptoz mekanizmalarındaki dengenin bozulması neticesinde oluşur. Kolon kanseri hücreleri, sağlıklı kolon hücrelerinin geçirdiği farklılaşmalara uğramazlar bu nedenle kolon kanseri oluşumunda, hücre farklılaşma mekanizması bozukluklarının önemli bir rolü olduğu düşünülmektedir. Şu ana kadar farklılaşma mekanizmalarının anlaşılmasına yönelik yapılan çalışmalarda, büyüme faktörleri ve hormonların farklılaşmada rol aldıkları gösterilmiştir. Bu çalışmalara rağmen, hücre farklılaşmasında hücre makromoleküllerinde yapısal, içerik ve fonksiyonel anlamda ne ölçüde ve ne tür değişikliklerin meydana geldiği ve bu değişikliklerin hücre fenotipine nasıl bir etkide bulunduğu tam olarak anlaşılamamıştır. Bu çalışma ile hücre farklılaşmasında meydana gelen söz konusu yapısal ve fonksiyonel değişikliklerin FTIR mikrospektroskopik görüntüleme ve Terahertz spektroskopisi gibi biyofiziksel metodlar kullanılarak açığa çıkarılması amaçlanmaktadır.Önerilen projede, hem spontan hem de bazı kimyasal ajanlar ile farklılaşabilen Caco-2 insan kolon adenokarsinoma hücre hattı kullanılacaktır. Çalışmada farklılaştırıcı ajan olarak kullanılması planlanan sodyum bütirat’ın kanser hücrelerinde proliferasyonu engellediği ve apoptoza neden olduğu daha önceki çalışmalarda gösterilmiş ve farklılaştırıcı ajan olabileceği belirtilmiştir. Grubumuzun BAP.07.02.2012.004 nolu proje kapsamında yaptığı ATR-FTIR çalışmaları ile Caco-2 hücreleri üzerinde sodyum bütiratın farklılaştırıcı etkisi gözlenmiştir. Önerdiğimiz projede farklılaşma örüntülerinin hem görsel hemde fonksiyonel olarak daha detaylı analizini yapmak amacıyla FTIR görüntüleme tekniğine başvurularak, sodyum bütiratın daha önceki çalışmamızda belirlediğimiz optimum etki dozunda zamana bağlı etkisi araştırılacaktır. Diğer yandan, yukarıda belirtilen proje kapsamında, THz spektroskopisinin hücre hatlarına uygulanması için yapılan optimizasyon çalışmaları sonucunda, hücreler için katı çekim tekniğinin uygulanmasının daha elverişli olduğu gözlemlenmiş ve bundan sonraki çalışmaların bu doğrultuda devam etmesi planlanmıştır. THz spektroskopisinin biyolojik sistemlere uygulamalarının ABD’de yoğun ilgiyle karşılanmasına karşılık, Avrupa’da istenilen düzeyde çalışılmadığı gözlenmektedir. Önerdiğimiz proje ile güçlü ve hassas bir teknik olan THz spektroskopisinin uygulama alanını hücre çalışmalarında geliştirmeyi amaçlamaktayız.Önerilen projeden elde edilecek bulgular farklılaşmış ve farklılaşmamış kolon epiteli hücreleri arasındaki farkı moleküler seviyede anlamamıza yardımcı olacak ve dolayısı ile kolon kanseri oluşumunda rol oynayan temel mekanizmaların anlaşılmasına ışık tutacaktır. Bu tip temel mekanizmaların anlaşılması gelecek için daha iyi tanı ve tedavi seçeneklerinin geliştirilmesine yarar sağlayacaktır.

Suggestions

İnsan Yağ Dokusundan Ayrılmış Mezenkimal Kök Hücrelerinin Kontrollü GDF-5 Salım ile Tendon Hücresine Farklılaştırılması ve PCL Nanofiber Hücre İskelesiyle Birlikte Tendon Doku Mühendisliği Yönünden Değerlendirilmesi
Keskin, Dilek; Tezcaner, Ayşen(2018-12-31)
Tendon oldukça hiyerarşik ve yönlü bir dokudur. Bu doku kas ve kemiğin birbirine bağlanmasında görev alır. Bu sayede kasın oluşturduğu mekanik kuvvet kemiğe aktarılır; bu durum hareketi sağlar. Tendon doku travmalarının en sık görülenleri aşil, diz ve omuz yaralanmalarıdır. Günümüzde uygulanan steroid olmayan yangı karşıtı ilaçlar, hastadan alınan (otogreft) ya da Allogreft, Xenogreftler, dikişler ve protezler hastalığın tedavisindeki beklentileri sınırlı olarak karşılamaya çalışmaktadır. Günümüzde doku müh...
ESSİTALOPRAM’IN SPİNGOMYELİN MODEL MEMBRANLARI İLE ETKİLEŞMESİNİN YAPISAL VE İŞLEVSEL AÇIDAN BİYOFİZİKSEL YÖNTEMLERLE ARAŞTIRILMASI
Severcan, Feride; Ergün, Seza(2013-12-31)
Psikiyatrik bozukluklar değişen yaşam koşulları ve artan stres faktörü nedeniyle günümüzde görülen en yaygın hastalıklar arasında yer almaktadır. Yeme ve uyku bozuklukları, madde bağımlılığı, hareket bozuklukları, şizofreni, bipolar bozukluk (manik depresyon), anksiyete bozuklukları, dikkat ve konsantrasyon sağlama güçlükleri ve depresyon gibi bozukluklar psikiyatrik hastalıkların en bilinen örnekleri arasında yer almaktadır Psikiyatrik hastalıkların, özellikle depresyonun, tedavisi için kullanılan en etkil...
Yaygın kanser tiplerinde transkriptom 3'UTR isoform çeşitliliğinin incelenmesi
Erson Bensan, Ayşe Elif; Can, Tolga(2018-12-31)
Farklı kanserlerin ardında yatan mekanizmaların anlaşılmasında gen anlatım çalışmaları çok öenmli olmuştur. Bu çalışmalar sayesinde anlatım düzeyleri bozulan pek çok mRNA bulunmuştur. Ancak geleneksel gen anlatım çalışmaları mRNA izoformlarının tespitinde ve miktarlarının ölçülmesinde yetersiz kalmaktadır. Bu projenin amacı geliştirmiş olduğumuz özel bir yazılımla en sık görülen kanser tiplerinde mRNA 3'UTR izoform profillerinin ortaya konmasıdır. Beklenen sonuç ise farklı kanser tiplerinde aktive olmuş ort...
Yerel tıbbi bitki Viscum album L.’un safra asit sentez ve metabolizmasından sorumlu sitokrom P450 7A1 ve 27A1 enzimlerine etkilerinin moleküler düzeyde incelenmesi
Adalı, Orhan; Güray, Nülüfer Tülün; Çulcu, Tuba(2015-12-31)
Tüm dünyada obezite rahatsızlığına sahip insan sayısı giderek artmaktadır. Obezite kandaki yağların artmasına ve iyi kolesterol olarak adlandırılan HDL’nin azalmasına neden olmaktadır. Bu değerlerin değişmesi kardiyovasküler hastalıkların ortaya çıkmasında etkilidir. Bu nedenle kolesterol metabolizması ve kolesterolün vucüttaki dengesi ve safra asitlerine dönüşümü klinik açıdan giderek önem kazanmaktadır. Son zamanlarda popüler olan bitkisel kökenli maddelerin antioksidan özelliklerinin araştırılması ile i...
Kan Beyin Bariyeri Ötesine Kontrollü Salım Sistemleri ile İlaç Taşınması
Keskin, Dilek; Tezcaner, Ayşen(2014-12-31)
Parkinson hastalığı beyinde dopamin miktarının azalmasından kaynaklanmaktadır. Dopamin vücut hareketlerini ve dengesini düzenleyen bir kimyasaldır ve eksikliğinde hasta hareket kabiliyetini yitirmeye başlar.Bu projede amaç beyine hedeflenmiş L-Dopa yüklü lipozomal sistemler hazırlanmasıdır. Nano boyutlarda hazırlanacak olan lipozomlar yüzey modifikasyonu ile beyine hedeflendirilecek ve KBB’yi geçmesi sağlanacaktır. Bu sistem ile daha az miktarda ilaç kullanılarak ilacın hedef dokuda istenilen doza ulaşması ...
Citation Formats
F. Severcan et al., “İnsan Kolon Adenokarsinoma Hücrelerinde Sodyum Bütirat Konsantrasyonuna Bağlı Oluşan Yapısal ve İçeriksel Farklılaşmaların Raman, FTIR ve Terahertz Spektroskopisi YöntemleriyleAraştırılması,” 2015. Accessed: 00, 2020. [Online]. Available: https://hdl.handle.net/11511/61919.