Protein Kinaz İnhibitörlerinin Hücre Sinyal Yollarındaki Yeni Hedeflerinin Sistem Biyolojisi Yöntemleri İle Tanımlanması

Date

2016-12-31

Author

Atalay, Rengül

Metadata

Show full item record

This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Item Usage Stats

853
views

0
downloads

ÖZETProtein kinazlar hücresel sinyal ileti yolaklarında anahtar görevi alarak alan hücrenin sağkalım ve ölüm mekanizmalarını kontrol ederler. Son yıllarda kanser tedavisinde kullanılmaya başlayan yeni kanser ilaçlarının büyük çoğunluğunu kinaz inhibitörü kemoterapötik ajanlar oluşturmaktadır. Bu ilaçların büyük çoğunluğunda, doza bağımlı olarak bir tek proteinin değil birden çok proteinin hücre sinyal yollarına etki ettiği gösterilmiştir. Bu bağlamda önerilen bu projenin özgün amacı tedaviye dirençli ve duyarlı karaciğer kanseri hücrelerinde protein kinaz inhibitörü-hücre sinyal yanıtı ilişkisinin PI3K/Akt sinyal yolu inhibitörleri ile sistem biyolojisi yöntemleri kullanılarak belirlenmesidir. Sonuç olarak kullanılacak inhibitörlerin daha önce ilaç yan etkisi olarak ifade edilen ancak son zamanlarda hedef dışı (off-target) etki olarak belirtilen etkileri tanımlanacaktır. Önerilen bu proje kapsamında RNA-Seq transkriptom dizileme verileri geniş ölçekli veri analizi ve sistem biyolojisi yaklaşımı ile analiz edilecektir. Bu etkiler hem kullanılan ilaçların yeni hedefe yönlendirilmesi (drug repurposing) ve yeni ilaç hedeflerinin belirlenmesini sağlayacaktır.

Subject Keywords

Biyoinformatik, Farmakogenetik, Kanser Moleküler Biyolojisi

URI

https://hdl.handle.net/11511/61990

Collections

Graduate School of Informatics, Project and Design

Suggestions

OpenMETU
Core

Meme dokusunun gelişim aşamalarının APA açısından analizi Erson Bensan, Ayşe Elif; Kiriş, Erkan; Muyan, Mesut; Gürsel, Mayda; Banerjee, Sreeparna; Terzi Çizmecioğlu, Nihal(2018-12-31) Farklı kanserlerin altında yatan mekanizmaların anlaşılmasında gen anlatım çalışmaları çok önemli olmuştur. Bu çalışmalar sayesinde anlatım düzeyleri bozulan pek çok mRNA bulunmuştur. Ancak, geleneksel gen anlatım çalışmaları, mRNA izoformlarının tespitinde ve miktarlarının ölçülmesinde yetersiz kalmaktadır. Bu projenin amacı, geliştirmiş olduğumuz özel bir yazılımla meme dokusunun gelişim aşamalarındaki değişimleri incelemektir.
Kolon kanserinde 15-lipoksijenaz-1 ve Nükleer Faktör kappa B (NF-kB)‘nin MTA1 ifadesini değiştiren karşılıklı etkileşimi. Banerjee, Sreeparna; Erson Bensan, Ayşe Elif; Muyan, Mesut(2014-12-31) Metastasis associated 1 (MTA1), pek çok tümör baskılayıcı geni inhibe eden, baskılayıcı nükleozom yeniden modelleme ve histon deasetilaz (NuRD) kompleksinin bir üyesidir. 15-lipoksijenaz-1(15-LOX-1) araşidonik asiti pek çok biyoaktif lipide dönüştüren inflamatuar eikosanoid yolağının bir üyesidir. Biz de 15-LOX–1 ifadesinin kolon kanseri hücre hatlarında metastatik potansiyeli azalttığını ve bu azalışın en azından bir kısmının MTA1 ifadesini azaltma yoluyla yaptığını rapor etmiş bulunmaktayız [ÇİMEN ve ark....
NEK6’nın Apoptoz, Hücre Döngüsü ve İnvasyon Üzerindeki Etkisinin Prednizon Dirençli Multipl Miyelom Hücre Hattında İncelenmesi Gündüz, Ufuk; Mutlu, Pelin; Keskin, Dilek(2015-12-31) Mitotik hücre döngüsünün hatasız bir şekilde başlaması ve devam etmesinde önemli role sahip olan NEK6, NIMA-ilişkili (Nek) serin-treonin kinazlardan birisidir. Son zamandaki çalışmalar, NEK6 gen mutasyonlarının; iğ ipliklerinde bozukluklara, anormal kromozom ayrılmasına, mitozun durdurulmasında ve apoptozda sorunlara neden olduğu göstermektedir.Bu çalışmada ilaç dirençli RPMI-8226 miyelom hücre hattında NEK6 gen ifadesi, siRNA ile susturularak, hücre döngüsü, DNA hasar yanıtı ve apoptozda rol aldığı bilinen...
Multipl Miyelomda Serum Açlığına Bağlı Otofajiden Sonra MikroRNA İfade Analizi Özen, Can; Banerjee, Sreeparna(2018-12-31) Bir kemik iliği kanseri olan Multipl Miyelom (MM) tüm kanserlerin %1 ini ve hematolojik kanserlerin %13 ünü oluşturur.Sıklıkla karşılaşılan nüksler ve kemoterapiye geliştirilen direnç gibi sebeplerden dolayı tedavisi olmayan bir hastalıktır.MM patofizyolojisinin anlaşılmasına yönelik araştırmalar, yeni ilaç hedeflerinin ortaya çıkarılmasına katkıda bulunacaktır.Hücresel strese yanıt olarak gerçekleşen otofazi, MM patofizyolojisinde önemli rol oynamaktadır.Otofaji enerji geri dönüşümü için aşırı/yanlış katla...
Yeni nesil moleküler veri analizi yoluyla genom ve transkriptom evriminin incelenmesi Somel, Mehmet; Ghalichi, Ayshin; Alici, Ahmet Yetkin; Turan, Zeliha Gözde; Izgi, Hamit; Baloğlu, Onur; Sağlican, Ekin; Parvizi, Poorya; Dönertaş, Handan Melike(2016-12-31) Tüm genom dizileme verisi, genom çapında veya ekzom çapında polimorfizm verisi, mikrodizin ve RNA-dizileme verisi, GC-MS metabolit verisi gibi geniş çaplı moleküler veri setlerinin hesaplamalı analizi yoluyla uzun zamandır biyologları meşgul eden çok sayıda sorunun cevaplanması bugün mümkün hale gelmiştir. Araştırma grubumuzda genom ve transkriptom evrimi üzerine şu soruları gelecek yıl içinde cevaplayamaya çalışacağız:- Primatlar arasında testis transkriptomu niye ve nasıl evrilmektedir? - Türler arasında ...

Citation Formats

R. Atalay, “Protein Kinaz İnhibitörlerinin Hücre Sinyal Yollarındaki Yeni Hedeflerinin Sistem Biyolojisi Yöntemleri İle Tanımlanması,” 2016. Accessed: 00, 2020. [Online]. Available: https://hdl.handle.net/11511/61990.