Isı şoku altında termofilik arkea'da (model: Thermoplasma volcanium) global gen anlatımındaki farklılaşmanın mikrodizin tekniği ile analizi

2015-12-31
Bu çalışmada ilk defa orta derecede termofilik (op. gelişme sıcaklığı 60 ºC) ve aynı zamanda asidofilik bir arkeon olan T. volcanium’da (pH 2.0) tüm genom mikrodizinleri kullanılarak ısı stresinin global gen ekspresyon profilini nasıl etkilediği araştırılacaktır. Böylece söz konusu stres koşulunda organizmanın geliştirdiği tepki mekanizmaları hakkında transkriptom düzeyinde bilgi edinmek mümkün olacaktır. Mikrodizin analizi ile elde edilecek sonuçlara göre belirlenecek bazı hedef genlerin anlatım düzeylerindeki değişim ayrıca qRT-PCR ile incelenerek her iki tekniğin karşılaştırmalı bir analizi yapılacaktır.

Suggestions

Sıcak ve Soğuk Stresi Altındaki Rhodobacter capsulatus bakterisinin Hidrojen Üretim Mekanizmasında Rol Alan Genlerinin İfadesinin QPCR Yöntemi İle İncelenmesi
Yücel, Ayşe Meral; Koku, Harun(2014-12-31)
Günümüzde enerji ihtiyacı büyük oranda fosil yakıtların tüketimi ile karşılanmaktadır. Fosil yakıtların yoğun kullanımı hem bu kaynakların azalmasına hem de çevre ve hava kirliliği ve küresel ısınmaya yol açmaktadır. Bu nedenle fosil yakıtlara alternatif enerji kaynaklarının geliştirilmesi büyük önem taşımaktadır. Yakıldığında yalnız su açığa çıkarması ve diğer yakıtlarla karşılaştırıldığında en yüksek gravimetrik enerji yoğunluğuna sahip olması (142 MJ/kg) hidrojeni iyi bir alternatif haline getirmektedir....
Analiz Kapsamindaalt Yapi Çalismasi.
Yücel, Ayşe Meral; Özen, Can; Şeker, Tamay(2013-12-31)
4. EKLER Bu projenin amaci ODTÜ Merkez Laboratuvar Moleküler Biyoloji Biyoteknoloji AR-GE Merkezi'nde baslatilan Akreditasyon çalismalarina yönelik olarak alt yapisinin güçlendirilmesi dir. 4.2. Arastirmanin Kapsami ve Zamana Bagli Is Plani Arastirma, ODTÜ Merkez Laboratuvar Moleküler Biyoloji Biyoteknoloji AR-GE Merkezi'nde akredite olunucak metotlar geregi tartilan maddelerin kütle araligina uygun hassasiyette terazinin kullanimi, bu terazinin özel kütle seti ile periyodik kalibrasyonu ve kullanilan ...
Tatlısu Acinetobacter türlerinin antibiyotik maruziyeti altında sergiledikleri moleküler değişimlerin belirlenmesi
Gözen, Ayşe Gül; Beklioğlu, Meryem; Gürsel, Mayda; Önde, Sertaç; Doğan, Musa; Togan, İnci Zehra; İzgü, Kadri Fatih; Özcengiz, Gülay; Bilgin, Cemal Can; Yücel, Ayşe Meral(2015-12-31)
Bu projenin amacı bir sığ tatlısu gölü olan Mogan’dan izole edilen Acinetobacter sp. bakterisinin farklı antibiyotiklerin sub-lethal konsantrasyonlarında göstermiş olduğu moleküler değişimlerin ATR-FTİR spektroskopisi ile belirlenmesidir. Bu amaç doğrultusunda farklı inhibisyon mekanizmalarına sahip üç farklı antibiyotik belirlenmiştir: ampisilin (Amp), neomisin (Nm) ve imipenem (Ipm). Bu üç antibiyotiğin çevresel kaynaklı Acinetobacter sp. üzerindeki minimum inhibisyon konsantrasyonları (MİK) belirlendikt...
Tut (adıyaman) Bölgesinde Yüzeyleyen Alt Paleozoyik Sedimanlarının Kalıntı Zirkonlarında U-Pb Ve Hf İzotop Çalışması Ve Güneydoğu Türkiye'nin Paleozoyik Tektonik Evrimindeki Önemi
Bozkurt, Erdin(2013-12-31)
Klastik sedimanlardaki kırıntılı (detrital) ve kalıntı (miras kalmış/inherited) zirkonlarda U-Pb ve Hf izotop çalışması birimlerin kökeni (provenans analizi) ile çökelimlerinden önceki döneme ait kıta kabuğunun evrimini ortaya konması için son yıllarda sıkça başvurulan bir çalışma türüdür. LA- SF-ICP-MS yönteminin uygulanacağı benzer bir çalışmanın güneydoğu Anadolu'da Tut (Adıyaman) bölgesinde yüzeyleyen Alt Paleozoyik kırıntılı kayaçlarında da yapılması planlanmıştır. Bu çalışmanın amacı bölgenin Erken ...
Bal Arılarının Virüs Ve Patojenlerinin Belirlenmesi Ve Bal Arılarının Bunlardan Bir Kısmına Tepkilerinin Ölçülmesi.
Muyan, Mesut(2013-12-01)
Araştırmanın kapsamı Çalışmamız arı ırklarının belirlenmesi ve etkenlere tepki deneyleri olarak iki kısımdan oluşmaktadır. Çalşmamızda ODTÜ Biyoloji Bölümü ortak bahçe arılığında yetiştirilen arılar kullanılacaktır. Arı ırklarının belirlenmesi Orta Doğu Teknik Üniversitesi’nde Prof. Dr. Aykut Kence’nin laboratuvarında geliştirilmiş olan morfometrik, enzim elektroforezi, ve mikrosatelit analizine dayalı ayrıştırma tekniği ile örneklenen tüm kovanlardaki arıların toraks kısmı (kanat, bacak ve kas doku) ırk ve...
Citation Formats
S. Kocabıyık, Ç. D. Son, and T. Yanık, “Isı şoku altında termofilik arkea’da (model: Thermoplasma volcanium) global gen anlatımındaki farklılaşmanın mikrodizin tekniği ile analizi,” 2015. Accessed: 00, 2020. [Online]. Available: https://hdl.handle.net/11511/58859.