İnsan ve şempanze beyninde 3'UTR kısalmalarının incelenmesi

2017-12-31
İnsan ve şempanze arasındaki davranışsal farkların genetik temelini anlamak için iki türün beyinlerindeki gen ifadesi farklarını araştırmanın gerekli olduğunu 40 yıl önce tespit edilmiştir. Son 15 yıl içinde bu iki türün beyinlerindeki gen ifadesi farklılıkları incelemek için mikrodizin ve RNA dizileme yöntemleriyle çok sayıda veri seti üretilmiştir. Ancak her bir ekibin üretmiş olduğu farklı veri setlerini diğer setlerle beraber analizlemek, istatistiksel gücü artırarak, türler arasındaki gerçek farkların tespiti açısından önemli üstünlük sağlayacaktır. Bu proje ile amacımız mikrodizin ve RNA dizileme veri setlerini yeniden işlemek ve ayrı ayrı olan veri setlerinin tek bir veri seti gibi kullanılmasını sağlamaktır. İkinci amacımız da klasik gen ifadesi farklarının ötesinde, türler arasında her bir gene ait mRNA’nın 3’UTR bölgesi uzunluğu farklarının incelenmesidir. Nitekim 3’UTR uzunluğu hangi mRNA’nın ne kadar proteine çevrildiğini belirleyen önemli bir özelliktir. Fark gösteren genlerin ortak işlevlerinin belirleneceği işlevsellik testleri yapılacak ve görülen farkların biyolojik düzeyde de anlamlı olup olmadıkları test edilecektir.

Suggestions

Yeni nesil moleküler veri analizi yoluyla genom ve transkriptom evriminin incelenmesi
Somel, Mehmet; Ghalichi, Ayshin; Alici, Ahmet Yetkin; Turan, Zeliha Gözde; Izgi, Hamit; Baloğlu, Onur; Sağlican, Ekin; Parvizi, Poorya; Dönertaş, Handan Melike(2016-12-31)
Tüm genom dizileme verisi, genom çapında veya ekzom çapında polimorfizm verisi, mikrodizin ve RNA-dizileme verisi, GC-MS metabolit verisi gibi geniş çaplı moleküler veri setlerinin hesaplamalı analizi yoluyla uzun zamandır biyologları meşgul eden çok sayıda sorunun cevaplanması bugün mümkün hale gelmiştir. Araştırma grubumuzda genom ve transkriptom evrimi üzerine şu soruları gelecek yıl içinde cevaplayamaya çalışacağız:- Primatlar arasında testis transkriptomu niye ve nasıl evrilmektedir? - Türler arasında ...
“Arkeolojik alanlardan çıkarılmış koyun kemiklerinden elde edilen aDNA kullanılarak evcil koyun evrimini anlamak”
Togan, İnci Zehra; Pişkin, Evangelia; Ekşi, Elçin(2013-12-31)
Türkiye, sığır, keçi, koyun gibi hayvanların evcilleştirilmesi sürecini ve bu süreçteki evrimsel aşamaları anlamak açısından büyük bir öneme sahiptir. Son arkeolojik araştırmalar, günümüzden yaklaşık 11.000 yıl önce başladığı düşünülen, ilk koyun evcilleştirme faaliyetlerinin Anadolu’nun güneydoğusunda ve neredeyse tamamen Türkiye sınırları içerisinde gerçekleşmiş olabileceğine işaret etmektedir. Dolayısı ile dünya üzerindeki tüm koyun ırklarının kökenlerini güneydoğu Anadolu’da evcilleştirilen ilk koyunlar...
Anadolu Neolitik insan popülasyonlarından aDNA eldesi, dizilemesi ve popülasyon genetiği analizi yoluyla Neolitik göç tarihinin anlaşılması
Birand Özsoy, Ayşegül Ceren; Kıratlı, Ozan; Kalaylıoğlu Akyıldız, Zeynep Işıl; Somel, Mehmet; Togan, İnci Zehra; Yüncü, Eren; Yaka, Reyhan; Kemahli, Mübeccel Çisel(2016-12-31)
Antik DNA insan popülasyonlarının tarihine dair doğrudan bilgi verebilmektedir. Son yıllarda yürütülen bir dizi aDNA çalışması, Neolitik Devrim’in Orta/Kuzey Avrupa’ya nasıl taşındığı sorusuna kısmen yanıt vermiş ve tarımın en azından kısmen göçlerle varlığına işaret etmiştir. Ancak göçlerin tam olarak nereden başladığı bilinmemektedir. Bir olasılık Orta/Yakın Doğu’dan başlayan sürekli bir göç dalgası, diğer bir olasılık, önce tarımın kültürel aktarımla Akdeniz topluluklarına taşınması ve Orta/Kuzey Avrupa’...
Kuzeydoğu Akdeniz Botryllid tulumlularının (Ascidians) moleküler teknikler kullanılarak tanımlanması ve karşılaştırılması
Karahan, Arzu; Zenginer Yılmaz, Arife; Salihoğlu, Barış(2018-12-31)
Tulumlular, deniz fıskiyeleri olarak bilinen ve çoğunlukla koloni oluşturarak yaşayan ilkel omurgalı formlarıdır. Son dönemlerde kök hücre ve biyoteknolojik çalışmalarda sıklıkla kullanılan model organizmalardan biridir. Üreme güçleri, kök hücre potansiyelleri ve rejenerasyon yetenekleri oldukça yüksektir. Omurgalılar içinde tüm vücut onarımını yapabilen tek canlı grubudurlar. Türkiye kıyılarındaki türleri ile ilgili yayınlanan birkaç morfolojik çalışma dışında üzerlerinde herhangi bir çalışma yapılmamıştır...
Türkiye Söğüt Türlerinin Moleküler Filogenetiği
Kaya, Zeki; Tümbilen Özer, Yeliz(2014-12-31)
Yapılan projenin başlıca amacı, Türkiye’nin çeşitli bölgelerinde yayılış gösteren Salix cinsine ait olan türlerin toplanması ve bunlarda moleküler teknikler kullanılarak filogenetik ilişkinin ortaya çıkarılmasıdır. : Ülkemiz son kayıtlara göre 11.025 tür ve türaltı taksonlar ile zengin bir floraya sahiptir. Bunun yaklaşık 3.316’sı endemiktir ve endemizm oranı % 33 civarındadır. Bu özelliklerinden dolayı ülkemiz önce yabancı daha sonra da Türk botanikçilerin ilgisini çekmiştir. Türkiye’de ilk defa Fransız ar...
Citation Formats
M. Somel, T. Can, and O. Baloğlu, “İnsan ve şempanze beyninde 3’UTR kısalmalarının incelenmesi,” 2017. Accessed: 00, 2020. [Online]. Available: https://hdl.handle.net/11511/61019.