SİN3A KOREPRESÖR KOMPLEKSİNİN FARE EMBRİYONİK KÖK HÜCRELERİNDE DNA HASAR VE ONARIM MEKANİZMALARINA ETKİSİ

Date

2018-12-31

Author

Terzi Çizmecioğlu, Nihal
Keskin, Ezgi Gül

Metadata

Show full item record

This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Item Usage Stats

337
views

0
downloads

Sin3a korepresor kompleksi içindeki histon deasetilaz proteinlerinin sayesinde gen ekspresyonunu bastırma görevi olan bir kromatin kompleksidir. Yaptığımız çalışmalarda, fare embriyonik kök hücrelerin pluripotent yapısını kaybedip mezoderm ve endoderm tabakalarına farklılaşmasında Sin3a kompleksinin içinde yer alan Arid4b ve Hdac1 proteinlerinin kritik bir rol oynadığını bulduk. Arid4b veya Hdac1 proteinlerinden yoksun hücreler farklılaşma için gerekli transkripsiyon faktörlerini ve daha alt basamaklardaki efektör proteinleri sentezleyememektedirler. Bu çalışmalarımız sırasında, arid4b∆ ve hdac1∆ fare embriyonik kök hücrelerinin farklılaşma sürecinde daha az sayıda hücre ürettiğini gözlemledik. Hücre döngüsü ve hücre farklılaşması arasında bir bağ olduğu bilinmektedir. Fakat bununla ilgili mekanizmalar konusunda bilgi sahibi değiliz. Daha önceki projemizde Sin3a kompleksinden yoksun fare embriyonik kök hücrelerinin daha az bir yüzdesinin hücre döngüsüne girdiğini ve hücre döngüsüne giren hücrelerin ise normal hücrelere oranla daha yüksek bir yüzdesinin S- fazında bulunduğunu gözlemledik. Bu bulgulara dayanarak, Sin3a protein kompleksinin DNA hasar ve onarım mekanizmalarında görev yapabileceğini tahmin ediyoruz. Bu BAP projesinde amaçladığımız, alanda kabul görmüş DNA hasar ve onarım belirteçlerini kullanarak önce embriyonik kök hücre safhasında sonra da endoderm tabakasına farklılaşmış hücrelerde analiz yapmak ve Sin3a kompleksi üzerindeki çalışmalarımızı sürdürmektir.

Subject Keywords

Moleküler Biyoloji ve Genetik

URI

https://hdl.handle.net/11511/62146

Collections

Department of Biology, Project and Design

Suggestions

OpenMETU
Core

SİN3A KOREPRESÖR KOMPLEKSİNİN EMBRİYONİK KÖK HÜCRE FARKLILAŞMASINDA HÜCRE BÖLÜNMESİ ÜZERİNDEKİ ETKİSİ Terzi Çizmecioğlu, Nihal(2016-12-31) Sin3a korepresor kompleksi içindeki histon deasetilaz proteinlerinin sayesinde gen ekspresyonunu bastırma görevi olan bir kromatin kompleksidir. Yaptığımız çalışmalarda, embriyonik kök hücrelerin pluripotent yapısını kaybedip mezoderm ve endoderm tabakalarına farklılaşmasında Sin3a kompleksinin içinde yer alan Arid4b ve Hdac1 proteinlerinin kritik bir rol oynadığını bulduk. Arid4b veya Hdac1 proteinlerinden yoksun hücreler farklılaşma için gerekli transkripsiyon faktörlerini ve daha alt basamaklardaki efekt...
NEK6’nın Apoptoz, Hücre Döngüsü ve İnvasyon Üzerindeki Etkisinin Prednizon Dirençli Multipl Miyelom Hücre Hattında İncelenmesi Gündüz, Ufuk; Mutlu, Pelin; Keskin, Dilek(2015-12-31) Mitotik hücre döngüsünün hatasız bir şekilde başlaması ve devam etmesinde önemli role sahip olan NEK6, NIMA-ilişkili (Nek) serin-treonin kinazlardan birisidir. Son zamandaki çalışmalar, NEK6 gen mutasyonlarının; iğ ipliklerinde bozukluklara, anormal kromozom ayrılmasına, mitozun durdurulmasında ve apoptozda sorunlara neden olduğu göstermektedir.Bu çalışmada ilaç dirençli RPMI-8226 miyelom hücre hattında NEK6 gen ifadesi, siRNA ile susturularak, hücre döngüsü, DNA hasar yanıtı ve apoptozda rol aldığı bilinen...
Kolon kanserinde 15-lipoksijenaz-1 ve Nükleer Faktör kappa B (NF-kB)‘nin MTA1 ifadesini değiştiren karşılıklı etkileşimi. Banerjee, Sreeparna; Erson Bensan, Ayşe Elif; Muyan, Mesut(2014-12-31) Metastasis associated 1 (MTA1), pek çok tümör baskılayıcı geni inhibe eden, baskılayıcı nükleozom yeniden modelleme ve histon deasetilaz (NuRD) kompleksinin bir üyesidir. 15-lipoksijenaz-1(15-LOX-1) araşidonik asiti pek çok biyoaktif lipide dönüştüren inflamatuar eikosanoid yolağının bir üyesidir. Biz de 15-LOX–1 ifadesinin kolon kanseri hücre hatlarında metastatik potansiyeli azalttığını ve bu azalışın en azından bir kısmının MTA1 ifadesini azaltma yoluyla yaptığını rapor etmiş bulunmaktayız [ÇİMEN ve ark....
G-proteine kenetli Adenosin A2A Receptörlerinin Hücre Zarında Gerçekleşen Etkileşimleri Son, Çağdaş Devrim(2013-12-31) G proteine kenetli reseptörler (GPKR) uzun yıllar boyunca hücre zarında tek reseptör olarak bulundukları ve sinyal iletiminde tekbaşlarına yeterli oldukları varsayımı ile çalışılmışlardır. Ancak son yıllardaki deneysel sonuçlar bu reseptörlerin birbirleri ile eşleşerek iki ya da daha fazla reseptörden oluşan gruplar halinde bulunabilecekleri fikrini ortaya koymuştur. GPKRlerin birbirleriyle eşleşmeleri dışında diğer zar proteinleriyle eşleşmeleri de işlevsel ve farmakolojik açıdan büyük önem taşımaktadır. G...
USP32 proteinin hücre içi lokasyonunun belirlenmesi Erson, Elif A.(2010) Hücre içinde gerçekleştirilen önemli translasyon sonrası modifikasyonlardan biri de ubikuitinasyondur. Ubikuitinin proteinlere eklenmesi kadar çıkartılmasının da protein stabilitesinin değiştirilmesi gibi önemli etkileri vardır. Bu proje kapsamında amacımız henüz karakterize edilmemiş olan bir ubikuitin proetazın (USP32) hüçre içi lokalizasyonunun belirlenmesiydi. Bu amaca ulaşmak için öncelikle USP32 farklı domen ve bölgelerini içeren üç farklı GFP füzyon proteini klonlandı. Bu yapılar florosan koruma anal...

Citation Formats

N. Terzi Çizmecioğlu and E. G. Keskin, “SİN3A KOREPRESÖR KOMPLEKSİNİN FARE EMBRİYONİK KÖK HÜCRELERİNDE DNA HASAR VE ONARIM MEKANİZMALARINA ETKİSİ,” 2018. Accessed: 00, 2020. [Online]. Available: https://hdl.handle.net/11511/62146.